Realizzato nel Palazzo Guicciardini, situato nel centro storico di Montopoli in Val d´Arno, il Museo Civico è stato allestito nella primavera del 2003.
L´obiettivo, fino dalla sua costituzione, è stato quello di raccogliere le testimonianze archeologiche, storiche, artistiche e naturalistiche di quest´area della Provincia di Pisa, per essere una sorta di "biglietto da visita" che invogli a riscoprire la ricchezza dei centri e del territorio circostante. Per tale motivo il Museo Civico è stato pensato e strutturato come il primo dei poli del un futuro "Sistema Museale Montopolese", per il quale sono state già individuate le altre sedi.